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Démographie ancienne de l’Echenilleur de la Réunion (Coracina newtoni), un oiseau forestier endémique en danger critique d’extinction : Rapport bibliographique / Jordi Salmona
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Titre : Démographie ancienne de l’Echenilleur de la Réunion (Coracina newtoni), un oiseau forestier endémique en danger critique d’extinction : Rapport bibliographique Type de document : texte imprimé Auteurs : Jordi Salmona, Auteur Editeur : Toulouse : Université Toulouse 3 (Paul Sabatier) Année de publication : 2009 Importance : 1 vol. (14 p.) Présentation : couv. ill. en coul., photogr. en coul., graph. en coul., cartogr. en coul. Langues : Français Mots-clés : [ECOPLANETE] 0100 - ECOLOGIE/MILIEUX NATURELS :0101 - ECOLOGIE:ECOLOGIE:BIOGEOGRAPHIE:ESPECE ENDEMIQUE
[ECOPLANETE] 0100 - ECOLOGIE/MILIEUX NATURELS :0101 - ECOLOGIE:ECOLOGIE:ESPECE RARE
[ECOPLANETE] 0200 - ENVIRONNEMENT:0201 - POLITIQUE DE L'ENVIRONNEMENT:POLITIQUE DE L'ENVIRONNEMENT:ESPECE PROTEGEE
[ECOPLANETE] 0200 - ENVIRONNEMENT:0202 - GESTION ET PROTECTION DE LA FAUNE ET DE LA FLORE
[ECOPLANETE] 0200 - ENVIRONNEMENT:0202 - GESTION ET PROTECTION DE LA FAUNE ET DE LA FLORE:PROTECTION DE LA FLORE
[ECOPLANETE] 1700 - SCIENCES:1701 - SCIENCES HUMAINES ET SOCIALES:HISTOIRE
[ECOPLANETE] 1800 - TYPES DE DOCUMENTS (ancien):BIBLIOGRAPHIE
[LOCALISATION GEOGRAPHIQUE] OCEAN INDIEN:MASCAREIGNES:ILE DE LA REUNION
[FAUNE] OISEAUX:PASSERIFORMES:CAMPEPHAGIDES:CORACINA NEWTONIRésumé : Ce document présente un bilan bibliographique de l’histoire démographique du Coracina newtoni à la lumière de l’histoire de l’île de La Réunion et des récentes estimations concernant la destruction de la flore de l’île. Note de contenu : Master 2 Recherche « Microbiologie, Ecologie» - Spécialité : Ecologie Evolution Biométrie - Année Universitaire 2008-2009.
Responsables : Damien Fouillot, Marc Salamolard, Lounès Chikhi et Christophe Thébaud.
Bibliogr. p.11-12
Vous pouvez retrouver l'intégralité de ce document au format PDF sur le site officiel du Life+ Cap Dom à l'adresse suivante :Nature du document : Bibliographie Code fiches action : P06/P06-03/P06-04 En ligne : https://lifecapdom.org/IMG/pdf/rapport_tuit-tuit_biblio_complet.pdf Format de la ressource électronique : Démographie ancienne de l’Echenilleur de la Réunion (Coracina newtoni), un oiseau forestier endémique en danger critique d’extinction : Rapport bibliographique [texte imprimé] / Jordi Salmona, Auteur . - Toulouse : Université Toulouse 3 (Paul Sabatier), 2009 . - 1 vol. (14 p.) : couv. ill. en coul., photogr. en coul., graph. en coul., cartogr. en coul.
Langues : Français
Mots-clés : [ECOPLANETE] 0100 - ECOLOGIE/MILIEUX NATURELS :0101 - ECOLOGIE:ECOLOGIE:BIOGEOGRAPHIE:ESPECE ENDEMIQUE
[ECOPLANETE] 0100 - ECOLOGIE/MILIEUX NATURELS :0101 - ECOLOGIE:ECOLOGIE:ESPECE RARE
[ECOPLANETE] 0200 - ENVIRONNEMENT:0201 - POLITIQUE DE L'ENVIRONNEMENT:POLITIQUE DE L'ENVIRONNEMENT:ESPECE PROTEGEE
[ECOPLANETE] 0200 - ENVIRONNEMENT:0202 - GESTION ET PROTECTION DE LA FAUNE ET DE LA FLORE
[ECOPLANETE] 0200 - ENVIRONNEMENT:0202 - GESTION ET PROTECTION DE LA FAUNE ET DE LA FLORE:PROTECTION DE LA FLORE
[ECOPLANETE] 1700 - SCIENCES:1701 - SCIENCES HUMAINES ET SOCIALES:HISTOIRE
[ECOPLANETE] 1800 - TYPES DE DOCUMENTS (ancien):BIBLIOGRAPHIE
[LOCALISATION GEOGRAPHIQUE] OCEAN INDIEN:MASCAREIGNES:ILE DE LA REUNION
[FAUNE] OISEAUX:PASSERIFORMES:CAMPEPHAGIDES:CORACINA NEWTONIRésumé : Ce document présente un bilan bibliographique de l’histoire démographique du Coracina newtoni à la lumière de l’histoire de l’île de La Réunion et des récentes estimations concernant la destruction de la flore de l’île. Note de contenu : Master 2 Recherche « Microbiologie, Ecologie» - Spécialité : Ecologie Evolution Biométrie - Année Universitaire 2008-2009.
Responsables : Damien Fouillot, Marc Salamolard, Lounès Chikhi et Christophe Thébaud.
Bibliogr. p.11-12
Vous pouvez retrouver l'intégralité de ce document au format PDF sur le site officiel du Life+ Cap Dom à l'adresse suivante :Nature du document : Bibliographie Code fiches action : P06/P06-03/P06-04 En ligne : https://lifecapdom.org/IMG/pdf/rapport_tuit-tuit_biblio_complet.pdf Format de la ressource électronique : Exemplaires
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité Num_403 _ _ Fichier numérique Centre de documentation siège Faune Exclu du prêt Documents numériques
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Rapport_biblio_Salmona_complet.pdfAdobe Acrobat PDFSignature of a Pre-Human Population Decline in the Critically Endangered Reunion Island Endemic Forest Bird Coracina newtoni / Jordi Salmona
Signature of a Pre-Human Population Decline in the Critically Endangered Reunion Island Endemic Forest Bird Coracina newtoni / Jordi Salmona
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Titre : Signature of a Pre-Human Population Decline in the Critically Endangered Reunion Island Endemic Forest Bird Coracina newtoni Type de document : texte imprimé Auteurs : Jordi Salmona, Auteur ; Marc Salamolard, Auteur ; Damien Fouillot, Auteur ; Thomas Ghestemme, Auteur ; [et al.], Auteur Editeur : Plos Année de publication : 2012 Collection : Plos one Importance : 13 p. Présentation : graph. en coul. Langues : Anglais Mots-clés : [ECOPLANETE] 0100 - ECOLOGIE/MILIEUX NATURELS :0101 - ECOLOGIE:ECOLOGIE:BIOGEOGRAPHIE:ESPECE ENDEMIQUE
[ECOPLANETE] 0100 - ECOLOGIE/MILIEUX NATURELS :0102 - ETRES VIVANTS:FAUNE:ANIMAL:OISEAU
[ECOPLANETE] 1700 - SCIENCES:1703 - SCIENCES DE LA VIE:SCIENCES DE LA VIE:BIOLOGIE:GENETIQUE
[LOCALISATION GEOGRAPHIQUE] OCEAN INDIEN:MASCAREIGNES:ILE DE LA REUNION
[FAUNE] OISEAUX:PASSERIFORMES:CAMPEPHAGIDES:CORACINA NEWTONIRésumé : Article paru sur Plus One :
La biodiversité exceptionnelle de La Réunion est menacée par les changements anthropiques du paysage survenus au cours des 350 années de colonisation humaine. Au cours de cette période, la taille de la population humaine est passée de 250 000 à 800 000 personnes. L’arrivée de l’être humain, le développement de l’agriculture, d’espèces envahissantes comme les rats et les chats et la déforestation ont entraîné la disparition de plus de la moitié des espèces de vertébrés de l’île. Pour les espèces restantes, des travaux importants sont en cours pour identifier les menaces et l'état de conservation, mais peu de travaux génétiques ont été menés sur certaines des espèces les plus menacées.
Dans cette étude, nous fournissons les premières données génétiques sur Coracina newtoni, espèce de Coucou de la Réunion, espèce en danger critique d'extinctionNote de contenu : August 2012 | Volume 7 | Issue 8
Vous pouvez retrouver l'intégralité de cet article à l'adresse suivante :Nature du document : Article scientifique En ligne : https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0043524 Format de la ressource électronique : Site internet Signature of a Pre-Human Population Decline in the Critically Endangered Reunion Island Endemic Forest Bird Coracina newtoni [texte imprimé] / Jordi Salmona, Auteur ; Marc Salamolard, Auteur ; Damien Fouillot, Auteur ; Thomas Ghestemme, Auteur ; [et al.], Auteur . - [S.l.] : Plos, 2012 . - 13 p. : graph. en coul.. - (Plos one) .
Langues : Anglais
Mots-clés : [ECOPLANETE] 0100 - ECOLOGIE/MILIEUX NATURELS :0101 - ECOLOGIE:ECOLOGIE:BIOGEOGRAPHIE:ESPECE ENDEMIQUE
[ECOPLANETE] 0100 - ECOLOGIE/MILIEUX NATURELS :0102 - ETRES VIVANTS:FAUNE:ANIMAL:OISEAU
[ECOPLANETE] 1700 - SCIENCES:1703 - SCIENCES DE LA VIE:SCIENCES DE LA VIE:BIOLOGIE:GENETIQUE
[LOCALISATION GEOGRAPHIQUE] OCEAN INDIEN:MASCAREIGNES:ILE DE LA REUNION
[FAUNE] OISEAUX:PASSERIFORMES:CAMPEPHAGIDES:CORACINA NEWTONIRésumé : Article paru sur Plus One :
La biodiversité exceptionnelle de La Réunion est menacée par les changements anthropiques du paysage survenus au cours des 350 années de colonisation humaine. Au cours de cette période, la taille de la population humaine est passée de 250 000 à 800 000 personnes. L’arrivée de l’être humain, le développement de l’agriculture, d’espèces envahissantes comme les rats et les chats et la déforestation ont entraîné la disparition de plus de la moitié des espèces de vertébrés de l’île. Pour les espèces restantes, des travaux importants sont en cours pour identifier les menaces et l'état de conservation, mais peu de travaux génétiques ont été menés sur certaines des espèces les plus menacées.
Dans cette étude, nous fournissons les premières données génétiques sur Coracina newtoni, espèce de Coucou de la Réunion, espèce en danger critique d'extinctionNote de contenu : August 2012 | Volume 7 | Issue 8
Vous pouvez retrouver l'intégralité de cet article à l'adresse suivante :Nature du document : Article scientifique En ligne : https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0043524 Format de la ressource électronique : Site internet Exemplaires
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité Num_320 _ _ Fichier numérique Centre de documentation siège Faune Exclu du prêt Structure génétique et signature d’un déclin démographique chez l’Echenilleur de la Réunion (Coracina newtoni), un oiseau forestier endémique en danger critique d’extinction / Jordi Salmona
Titre : Structure génétique et signature d’un déclin démographique chez l’Echenilleur de la Réunion (Coracina newtoni), un oiseau forestier endémique en danger critique d’extinction Type de document : texte imprimé Auteurs : Jordi Salmona, Auteur Editeur : Toulouse : Université Toulouse 3 (Paul Sabatier) Année de publication : 2009 Importance : 1 vol. (31 p.) Présentation : cartogr. en coul., graph. en coul. Langues : Français Mots-clés : [ECOPLANETE] 0100 - ECOLOGIE/MILIEUX NATURELS :0101 - ECOLOGIE:ECOLOGIE:BIOGEOGRAPHIE:ESPECE ENDEMIQUE
[ECOPLANETE] 0100 - ECOLOGIE/MILIEUX NATURELS :0101 - ECOLOGIE:ECOLOGIE:ESPECE MENACEE
[ECOPLANETE] 0100 - ECOLOGIE/MILIEUX NATURELS :0101 - ECOLOGIE:ECOLOGIE:ESPECE RARE
[ECOPLANETE] 0200 - ENVIRONNEMENT:0201 - POLITIQUE DE L'ENVIRONNEMENT:POLITIQUE DE L'ENVIRONNEMENT:ESPECE PROTEGEE
[ECOPLANETE] 0200 - ENVIRONNEMENT:0202 - GESTION ET PROTECTION DE LA FAUNE ET DE LA FLORE:PROTECTION DE LA FAUNE
[ECOPLANETE] 0200 - ENVIRONNEMENT:0203 - GESTION ET PROTECTION DES ESPACES NATURELS:CONSERVATION DE LA NATURE
[ECOPLANETE] 1700 - SCIENCES:1703 - SCIENCES DE LA VIE:SCIENCES DE LA VIE:BIOLOGIE:GENETIQUE
[LOCALISATION GEOGRAPHIQUE] OCEAN INDIEN:MASCAREIGNES:ILE DE LA REUNION
[FAUNE] OISEAUX:PASSERIFORMES:CAMPEPHAGIDES:CORACINA NEWTONIRésumé : L’importante biodiversité de l’Ile de la Réunion a été largement détruite par l’homme depuis sont installation il y a 350 ans. Cette étude s’intéresse à l’échenilleur de la Réunion, C. newtoni, un oiseau forestier endémique en danger critique d’extinction, dont la population est aujourd’hui restreinte sur un territoire de 11 km2 de forêt de montagne. L’effectif actuel identifié se compose de 22 couples et 22 mâles solitaires. Le sex-ratio de la population est biaisé en faveur des mâles.
L’étude bibliographique analyse les théories relatives à la démographie passée de C. newtoni, à partir (i) de témoignages anciens, (ii) d’estimations de la taille de la population, (iii) de comparaisons aux autres espèces de Coracina, et de (iv) l’histoire de l’Ile de la Réunion. Les théories sont résumées et discutées, et trois hypothèses concernant la répartition de la population avant l’arrivée de l’espèce humaine sont proposées.
Nos recherches se sont concentrées sur la caractérisation génétique de la population de C. newtoni. Un test de sexage par PCR a été utilisé avec succès pour sexer les 46 poussins échantillonnés de 2003 à 2009, et a montré un sex-ratio à la naissance inférieure à celui de la population. Dix neuf marqueurs microsatellites polymorphes ont été identifiés. Nous mettons en évidence que la population possède une faible diversité génétique, ne semble pas consanguine, et montre un faible signal d’isolement par la distance. A partir de méthode bayésiennes nous détectons un déclin passé de la population conséquence de la destruction de l’habitat, et de l’introduction de prédateur par l’espèce humaine. Cet important déclin d’une magnitude de deux, semble très probablement avoir eu lieu au cours des quatre derniers siècles. Ces résultats valident les théories démographiques, et justifient les actions de conservation.Note de contenu : Master 2 Recherche « Microbiologie, Ecologie» - Spécialité : Ecologie Evolution Biométrie
Année Universitaire 2008-2009
Responsables : Damien Fouillot, Marc Salamolard, Lounès Chikhi et Christophe Thébaud
Bibliogr. p.23-27Nature du document : Rapport Code fiches action : P06/P06-03 Structure génétique et signature d’un déclin démographique chez l’Echenilleur de la Réunion (Coracina newtoni), un oiseau forestier endémique en danger critique d’extinction [texte imprimé] / Jordi Salmona, Auteur . - Toulouse : Université Toulouse 3 (Paul Sabatier), 2009 . - 1 vol. (31 p.) : cartogr. en coul., graph. en coul.
Langues : Français
Mots-clés : [ECOPLANETE] 0100 - ECOLOGIE/MILIEUX NATURELS :0101 - ECOLOGIE:ECOLOGIE:BIOGEOGRAPHIE:ESPECE ENDEMIQUE
[ECOPLANETE] 0100 - ECOLOGIE/MILIEUX NATURELS :0101 - ECOLOGIE:ECOLOGIE:ESPECE MENACEE
[ECOPLANETE] 0100 - ECOLOGIE/MILIEUX NATURELS :0101 - ECOLOGIE:ECOLOGIE:ESPECE RARE
[ECOPLANETE] 0200 - ENVIRONNEMENT:0201 - POLITIQUE DE L'ENVIRONNEMENT:POLITIQUE DE L'ENVIRONNEMENT:ESPECE PROTEGEE
[ECOPLANETE] 0200 - ENVIRONNEMENT:0202 - GESTION ET PROTECTION DE LA FAUNE ET DE LA FLORE:PROTECTION DE LA FAUNE
[ECOPLANETE] 0200 - ENVIRONNEMENT:0203 - GESTION ET PROTECTION DES ESPACES NATURELS:CONSERVATION DE LA NATURE
[ECOPLANETE] 1700 - SCIENCES:1703 - SCIENCES DE LA VIE:SCIENCES DE LA VIE:BIOLOGIE:GENETIQUE
[LOCALISATION GEOGRAPHIQUE] OCEAN INDIEN:MASCAREIGNES:ILE DE LA REUNION
[FAUNE] OISEAUX:PASSERIFORMES:CAMPEPHAGIDES:CORACINA NEWTONIRésumé : L’importante biodiversité de l’Ile de la Réunion a été largement détruite par l’homme depuis sont installation il y a 350 ans. Cette étude s’intéresse à l’échenilleur de la Réunion, C. newtoni, un oiseau forestier endémique en danger critique d’extinction, dont la population est aujourd’hui restreinte sur un territoire de 11 km2 de forêt de montagne. L’effectif actuel identifié se compose de 22 couples et 22 mâles solitaires. Le sex-ratio de la population est biaisé en faveur des mâles.
L’étude bibliographique analyse les théories relatives à la démographie passée de C. newtoni, à partir (i) de témoignages anciens, (ii) d’estimations de la taille de la population, (iii) de comparaisons aux autres espèces de Coracina, et de (iv) l’histoire de l’Ile de la Réunion. Les théories sont résumées et discutées, et trois hypothèses concernant la répartition de la population avant l’arrivée de l’espèce humaine sont proposées.
Nos recherches se sont concentrées sur la caractérisation génétique de la population de C. newtoni. Un test de sexage par PCR a été utilisé avec succès pour sexer les 46 poussins échantillonnés de 2003 à 2009, et a montré un sex-ratio à la naissance inférieure à celui de la population. Dix neuf marqueurs microsatellites polymorphes ont été identifiés. Nous mettons en évidence que la population possède une faible diversité génétique, ne semble pas consanguine, et montre un faible signal d’isolement par la distance. A partir de méthode bayésiennes nous détectons un déclin passé de la population conséquence de la destruction de l’habitat, et de l’introduction de prédateur par l’espèce humaine. Cet important déclin d’une magnitude de deux, semble très probablement avoir eu lieu au cours des quatre derniers siècles. Ces résultats valident les théories démographiques, et justifient les actions de conservation.Note de contenu : Master 2 Recherche « Microbiologie, Ecologie» - Spécialité : Ecologie Evolution Biométrie
Année Universitaire 2008-2009
Responsables : Damien Fouillot, Marc Salamolard, Lounès Chikhi et Christophe Thébaud
Bibliogr. p.23-27Nature du document : Rapport Code fiches action : P06/P06-03 Exemplaires
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité Num_378 _ _ Fichier numérique Centre de documentation siège Faune Exclu du prêt The utility of existing passerine microsatellite markers for genetic studies in endangered species : as demonstrated for a critically endangered forest bird endemic to Réunion Island, the Re´union cuckooshrike (Coracina newtoni) / Jordi Salmona
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Titre : The utility of existing passerine microsatellite markers for genetic studies in endangered species : as demonstrated for a critically endangered forest bird endemic to Réunion Island, the Re´union cuckooshrike (Coracina newtoni) Type de document : texte imprimé Auteurs : Jordi Salmona, Auteur ; Damien Fouillot, Auteur ; Thomas Ghestemme, Auteur ; Marc Salamolard, Auteur ; [et al.], Auteur Editeur : New-York : Springer Année de publication : 2010 Collection : Conservation Genetics Resources Importance : n.p. [ca 4] Langues : Anglais Mots-clés : [ECOPLANETE] 0100 - ECOLOGIE/MILIEUX NATURELS :0101 - ECOLOGIE:ECOLOGIE:BIODIVERSITE:RESSOURCE GENETIQUE
[ECOPLANETE] 0100 - ECOLOGIE/MILIEUX NATURELS :0101 - ECOLOGIE:ECOLOGIE:BIOGEOGRAPHIE:ESPECE ENDEMIQUE
[ECOPLANETE] 0100 - ECOLOGIE/MILIEUX NATURELS :0102 - ETRES VIVANTS:FAUNE:ANIMAL:OISEAU
[ECOPLANETE] 1700 - SCIENCES:1703 - SCIENCES DE LA VIE:SCIENCES DE LA VIE:BIOLOGIE:GENETIQUE
[FAUNE] OISEAUX:PASSERIFORMES:CAMPEPHAGIDES:CORACINA NEWTONIRésumé : Article paru dans le journal Conservation Genetics Resources :
Les données génétiques sont de plus en plus reconnues pour leur utilité dans les programmes de conservation. Cependant, de nombreuses espèces en danger appartiennent à des familles peu étudiées. En raison de l'urgence de leur état de conservation, il est important d'identifier rapidement les locus microsatellites polymorphes à partir des ressources disponibles. Nous montrons avec Coracina newtoni, l'échenilleur de la Réunion, que cette stratégie peut être très utile. En utilisant 110 jeux d’amorces microsatellites de passereaux, nous avons identifié 18 locus polymorphes et les avons testés chez 25 individus de C. newtoni. Suite à une correction de Bonferroni, une paire de loci a présenté un déséquilibre de liaison (valeur p \ 0,0001).En ligne : https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs12686-010-9254-x Format de la ressource électronique : Site internet The utility of existing passerine microsatellite markers for genetic studies in endangered species : as demonstrated for a critically endangered forest bird endemic to Réunion Island, the Re´union cuckooshrike (Coracina newtoni) [texte imprimé] / Jordi Salmona, Auteur ; Damien Fouillot, Auteur ; Thomas Ghestemme, Auteur ; Marc Salamolard, Auteur ; [et al.], Auteur . - New-York : Springer, 2010 . - n.p. [ca 4]. - (Conservation Genetics Resources) .
Langues : Anglais
Mots-clés : [ECOPLANETE] 0100 - ECOLOGIE/MILIEUX NATURELS :0101 - ECOLOGIE:ECOLOGIE:BIODIVERSITE:RESSOURCE GENETIQUE
[ECOPLANETE] 0100 - ECOLOGIE/MILIEUX NATURELS :0101 - ECOLOGIE:ECOLOGIE:BIOGEOGRAPHIE:ESPECE ENDEMIQUE
[ECOPLANETE] 0100 - ECOLOGIE/MILIEUX NATURELS :0102 - ETRES VIVANTS:FAUNE:ANIMAL:OISEAU
[ECOPLANETE] 1700 - SCIENCES:1703 - SCIENCES DE LA VIE:SCIENCES DE LA VIE:BIOLOGIE:GENETIQUE
[FAUNE] OISEAUX:PASSERIFORMES:CAMPEPHAGIDES:CORACINA NEWTONIRésumé : Article paru dans le journal Conservation Genetics Resources :
Les données génétiques sont de plus en plus reconnues pour leur utilité dans les programmes de conservation. Cependant, de nombreuses espèces en danger appartiennent à des familles peu étudiées. En raison de l'urgence de leur état de conservation, il est important d'identifier rapidement les locus microsatellites polymorphes à partir des ressources disponibles. Nous montrons avec Coracina newtoni, l'échenilleur de la Réunion, que cette stratégie peut être très utile. En utilisant 110 jeux d’amorces microsatellites de passereaux, nous avons identifié 18 locus polymorphes et les avons testés chez 25 individus de C. newtoni. Suite à une correction de Bonferroni, une paire de loci a présenté un déséquilibre de liaison (valeur p \ 0,0001).En ligne : https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs12686-010-9254-x Format de la ressource électronique : Site internet Exemplaires
Code-barres Cote Support Localisation Section Disponibilité Num_319 _ _ Fichier numérique Centre de documentation siège Faune Exclu du prêt